Wetenschappers creëren ‘s werelds grootste chimpansee-DNA-genoom uit kak

Een internationaal team van experts heeft ‘s werelds grootste genomische catalogus voor wilde chimpansees samengesteld door DNA te sequensen dat is gevonden in honderden monsters van uitwerpselen van apen.

Het team werd geleid door het Instituut voor Evolutionaire Biologie (IBE), het Duitse Centrum voor Integratief Biodiversiteitsonderzoek (iDiv), het Max Planck Instituut voor Evolutionaire Antropologie (MPI EVA) en de Universiteit van Leipzig.

Een verklaring verkregen van iDiv onthulde dat de experts genomische informatie hadden verzameld van honderden fecale monsters van chimpansees.

Ze zeggen dat de DNA-kaart vragen over het evolutionaire verleden van apen kan ophelderen en kan worden gebruikt om stropers en mensenhandelaars aan te pakken.

Gezien de bijna volledige afwezigheid van fossielen van chimpansees, is volgens Duitse en Spaanse wetenschappers de genetische informatie van huidige populaties cruciaal voor het beschrijven van hun evolutionaire geschiedenis.
Pixabay/Zenger

De iDiv-verklaring zei: “De nieuwe genomische atlas, gepubliceerd in het tijdschrift Cell Genomics, heeft het potentieel om routes en bronnen van illegale handel in kaart te brengen die kunnen worden gebruikt om deze bedreigde diersoort te beschermen.”

Ze legden uit dat chimpansees in bossen en wouden in de tropische Afrikaanse savanne leven en dat, in tegenstelling tot oude menselijke sites, voornamelijk in grotten en gematigde klimaten, de plaatsen waar chimpansees leven, ertoe hebben geleid dat er maar heel weinig “exemplaren bewaard of ontdekt zijn in het archeologische archief. “

De experts zeiden: “Gezien de bijna volledige afwezigheid van fossielen van chimpansees, is de genetische informatie van de huidige populaties cruciaal om hun evolutionaire geschiedenis en hun genetische diversiteit te beschrijven en bij te dragen aan hun instandhouding.”

De verklaring voegde toe: “Genetische informatie is verkregen met behulp van nieuwe technologieën, van honderden niet-invasieve verzamelde fecale monsters van chimpansees.

“Voor het eerst zijn methoden die zijn toegepast om oud DNA in menselijke populaties te analyseren, gebruikt om genetische informatie op te halen uit fecale monsters van mensapen.

“Verder kan de door het team ontwikkelde genomische database in de praktijk worden gebruikt voor het behoud van chimpansees, zoals het identificeren van illegale handelsroutes van producten van wilde dieren en wezen.”

Fotocompositie van wilde chimpansees
Fotocompositie van wilde chimpansees door de Pompeu Fabra University in Barcelona, ​​Spanje.
MPI-EVA PanAf, ChimandSee.org/Zenger

Door meer dan 800 monsters van chimpanseepoep te verzamelen, zou het onderzoek kunnen helpen migratiepatronen in kaart te brengen die 100.000 jaar teruggaan, zeggen de experts.

Professor Tomas Marques-Bonet, van de IBE en een co-auteur van de studie, zei: “Met behulp van methoden die zijn ontworpen om oud DNA te bestuderen, zoals in het geval van Neanderthalers, zijn we in staat geweest om genomische informatie op te halen uit fecale monsters, die erg moeilijk om mee te werken.

“We hebben die benadering toegepast op een ongekend aantal chimpanseemonsters uit het veld.”

Dr. Claudia Fontsere, een onderzoeker bij de IBE Comparative Genomics-groep en de eerste auteur van de studie, zei: “We hebben gezien dat fecale monsters, hoewel ze technische problemen opleveren, zeer waardevolle genomische informatie opleveren voor de studie van wilde chimpanseepopulaties, en stellen ons ook in staat om ze te geo-referentie en contacten tussen populaties te volgen zonder hun welzijn aan te tasten.”

Ze voegde eraan toe: “We hebben gemerkt dat, hoewel twee gemeenschappen geografisch heel dicht bij elkaar liggen, ze soms aan twee verschillende kanten van een rivier leven en slechts zeer beperkt en sporadisch contact hebben gehad.

“Onze aanpak is zeer nuttig bij het identificeren van barrières en natuurlijke corridors tussen populaties en kan gevolgen hebben voor het behoud ervan.”

Claudia Fontsere chimpansee studie
Claudia Fontsere, eerste auteur van de studie en onderzoeker bij IBE, verwerkt fecale monsters in het laboratorium.
Claudia Fontsere/Zenger

Co-auteur Dr. Mimi Arandjelovic, een onderzoeker aan iDiv, MPI EVA en Leipzig University, die acht jaar heeft besteed aan het verzamelen van gedrags-, ecologische en organische gegevens van het hele chimpanseebereik, zei: “Chimpansees hebben, net als mensen, een complexe evolutionaire geschiedenis.

“Hun dynamiek en gebieden met vroegere en huidige populatiecontacten moeten duidelijk worden geïdentificeerd om bij te dragen aan de bescherming van deze bedreigde diersoort.”

Arandjelovic is ook mededirecteur van het Pan African Program: The Cultured Chimpanzee (PanAf), een consortium van onderzoekers en natuurbeschermers uit Afrika, Europa en Noord-Amerika.

Chimpansees staan ​​vermeld als bedreigd op de Rode Lijst van bedreigde diersoorten van de Internationale Unie voor het behoud van de natuur (IUCN).

De nieuwe tool zal onderzoekers helpen uit te vinden waar individuen oorspronkelijk vandaan kwamen, wat tot nu toe niet mogelijk was.

De verklaring zei: “De nieuwe genomische tool heeft het team in staat gesteld om betrouwbaar te identificeren waar individuen vandaan komen; een taak die tot nu toe niet haalbaar was.

“Het vermogen om de oorsprong van chimpansees nauwkeurig te bepalen, heeft directe toepassingen voor hun instandhouding, zoals het opsporen van de plaatsen waar hun stroperij zich zou kunnen concentreren en het identificeren van de routes en oorsprong van illegale chimpanseehandel.”

Marques-Bonet voegde toe: “Het ontwikkelde instrument kan de herkomst van de in beslag genomen chimpansees, die meestal op slechts een paar honderd kilometer van hun werkelijke oorsprong worden gevonden, afleiden en zo betrouwbare informatie verschaffen over de regio’s die het meest bescherming nodig hebben.”

Dit verhaal werd aan Newsweek verstrekt door Zenger News.

Leave a Reply

Your email address will not be published.